软件教程 | StrainR2-宏基因组定量菌株丰度
📅 官方地址:https://github.com/BisanzLab/StrainR2
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📅 官方地址:https://github.com/molevol-ub/bitacora Read More
微生物组研究前沿从对微生物的形...
16S rRNA基因测序引物 标题:Microbial Diversity Biased Estimation Caused by Intragenomic Heterogeneity and Interspecific Conservation of 16S rRNA Genes 日期:2023年4月27日 作者:周宁一 单...
标题:Engineering plant microbiomes by integrating eco-evolutionary principles into current strategies 单位:英属哥伦比亚大学微生物与免疫学系 日期:2022年11月25日 作者:Cara H. Han...
很高兴地宣布Greengenes数据库的新版本,完全从头开始重新设计,以全基因组为支持,重点是协调16S rRNA和shotgun宏基因组数据集。由于设计上的重大变化,将新数据库命名为Greengenes2。然而,就像最初的Greengenes一样,它依赖于一个全新的系统发育,并表达了一个来自系统发育的分类学。 这篇论坛文章的重...
软件教程 | Bitacora:基因组组件中基因家族识别和注释的综合工具
用于追踪合成菌群和组装动态的稳定荧光标记
导读
16S rRNA基因测序引物
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Region
Primer name
Sequence (5′–3′)
Reference
AEM | 16S rRNA基因的基因组内异质性和种间保守性导致的微生物多样性估计偏差 | 2023
Curr. Opin. Plant Biol. | 整合生态进化原理以设计植物微生物群 | 2022
Microbiome-多基因组代谢模型预测拟南芥根际微生物功能互相依赖-2022
Multi-genome metabolic modeling predicts functional inter-dependencies in the Arab...
Introducing Greengenes2 2022.10
介绍