背景介绍：小张准备把前辈文献里的二代测序数据下载进行重复分析，于是开心的查找从NCBI数据库下数据的方法。可是，事情并不是太顺利。从一些网络资料那里知道aspera下载速度快，但是我总是报错，最后还是转向prefetch下载，速度不太快。不过，今天，Aspera，YES！

日期：2020年8月26日

编辑：小张 Read More

标题：根系分泌物类型决定根际微生物菌群结构和抑病功能

单位：南京农业大学，有机固体废物利用江苏省重点实验室

日期：2020年7月7日

摘要

背景：植物来源的低分子量化合物在塑造土壤微生物群功能中起着至关重要的作...

日期：2021年9月1日

参考：QIIME 2教程. 13训练特征分类器TrainingFeatureClassifiers(2021.2)_刘永鑫的博客——宏基因组公众号-CSDN博客 Read More

什么是K-mer?

mer 在分子生物学领域中意义为：monomeric unit，意即单体单元，相当于nt或者bp都可以。通常用于双链核酸中的单位，100 mer DNA相当于每一条链有100nt，那么整条链就是100bp。

k-mer...

通讯作者：Alexandre Jousset

单位：Nanjing Agricultural University & Utrecht University, Institute for Environmental Biology

参与人：Zhong Wei; Tian-jie Yang; Qi-rong S...

A plant genetic network for preventing dysbiosis in the phyllosphere

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PLOS PATHOGENS | 密歇根州立大学何胜阳团队系统解读植物界的微生物群落稳态！

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一、什么是进化树

系统发育进化树 (Phylogenetic tree)： 一般也叫系统进化树，进化树。它可以利用树状分支图形来表示各物种或基因间的亲缘关系。

分支系统发育分析 (Molecular phylogenetic analysis)： 是用来研究...